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成立地理与海洋学院是基于我们系已有的基础与专长，是适应国家发展的需求与对新型学科发展进步的推动。
南京大学地理科学是以自然地理学为国家重点学科，同时，发展经济地理学、进而发展为城市规划，及地图学发展为遥感与地理信息系统。
在自然地理学国家重点学科中是以地貌学与第四纪地质学为主力，同时发展水文地理与土壤地理。而且自然地理学中的重点学科方向为海岸带研究，于1990年后由计委、自然基金委、教委支持批准为由世行贷款组建的海岸与海岛开发国家试点实验室（pilot laboratory），试点成功应升为国家重点实验室。试点实验室是以海岸与海岛研究为代表通过评审验收。但后来，国家重点实验室归由科委领导，不知为何对世行贷款的试点实验室升级没落实，嗣后被批准为教育部重点实验室，研究领域是海岸、大陆架、海岛，发展为整个海陆交互作用过渡带。这是我们学校区别于专长研究陆地、区别于专长研究海洋的独特处，是专门研究海陆交互作用过渡带发展变化、环境、资源开发利用与海洋权益的研究机构。培养自然科学、社会科学与技术科学交叉的人才。如果认真检索系内的成果，在历年系内著作、获奖方面，海洋室均做出突出的贡献。
自1994年联合国海洋法贯彻执行后，大陆架划归沿海国管辖，兴起了全球对海洋疆界的关注，我国濒临黄、东、南海及太平洋，“海洋国土”达300万km2；海陆交互带是新鲜水、气之源泉；目前与相邻国家权益之争主要在海域。研究包括海岸带、大陆架及大陆坡在内之海岸海洋，是社会经济发展对环境、资源之需求，是卫护国家权益之需求，从甲午海战至今海域岛屿归属权之争执与被侵占，这种现状仅用“抗议”是改变不了的，应增强海洋教育、研究、生产与维权之实力。南大的海洋工作，正是在海洋疆域的海陆交互带，适应新纪元之需求，在已有的基础上发展的。国家十一五规划中，首次将海洋提为重点，将原来的系科扩建为地理与海洋学院是发展新学科培育交叉型人才的前进之举。地理学、海洋学都是一级学科，以一级学科冠名，为人才培养与就业，提供了更为广阔的前景。南大地学有雄厚之基础，首先改革前进，是应予大力支持的。
正如地球系统科学进步一样，地理学也在进步。城市建设兴起，城市科学发展，建立独立的城市与区域规划系，是在原有基础上进步。同时地理信息科学独立建系，旅游与国土资源分别建系，这些是在原地理科学中之发展与进步。那么，原有的海洋科学系列也应发展，学院中仅设一个海岸海洋科学系，它与教育部重点实验室结合，加强了学院的力量，赋予新的生长点，而并未改变原有的系内成分。更何况，本系从事海岸海洋科学研究与人才培养的历史，要早于城规、土地与旅游方面。现在相互交叉，学科与地区优势互补，更是共同进步，扩展了人才培养领域。
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