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1、 科研经费增长实现了历史性的突破。2008年度科研经费达到5．28亿，比2007年度增加 44．3％，跃入5亿元高校行列。
2、 科技成果又获丰收。在2008年度科技奖励中，获得8项教育部高等学校科学研究优秀成果奖(一等奖3项、二等奖5项)；4项江苏省科技进步奖(二等奖3项、三等奖1项)、1项江苏省建设科学技术二等奖。
3、 国家目标导向的重大科研项目取得了新的突破。获得2个科技重大专项的项目首席，获得1项重大科学研究计划项目首席，获得“863计划”2项重大重点项目课题，3项专题课题；国家自然科学基金项目取得新突破：资助经费首次突破1个亿，资助项目突破200项。
4、 科技队伍人才济济。获得国家杰出青年科学基金资助项目7项，获国家自然科学基金创新研究群体计划项目1项，教育部新世纪优秀人才支持计划项目23项。教育部长江学者和创新团队发展计划创新团队3项。
5、 专利战略成绩显著。2008年度我校共申请发明专利370项，授权发明专利177项。
6、 SCI论文质量不断提高。据公布的SCI论文统计结果，2007年度我校发表SCI论文1483篇，其中影响因子大于3．0的论文达470篇，论文质量进一步提高。
7、 重点实验室建设工作成绩优异。南京微结构国家实验室室顺利完成新大楼入驻搬迁，筹建工作已进入试运行阶段。在教育部化学学科重点实验室评估工作中，我校参评的“介观化学”和“生命分析化学”两个教育部重点实验室均获得优良成绩，其中生命分析化学重点实验室获得优秀。“现代天文与天体物理”和“模式动物与疾病研究”两个教育部重点实验室顺利通过教育部组织的筹建专家论证。
8、 国防科研取得新进展。2008年我校国防科研创新平台建设取得重大进展，“电磁波特征信息调控技术国防重点学科实验室”、“国防科技创新团队”、“高性能高分子材料与技术教育部重点实验室(B类)”获得批准立项。
9、 科技成果转化中心成为首批国家技术转移示范机构。这是江苏省高校唯一的国家技术转移示范机构。
10、科技成果转化实现跨越发展。建设政校企合作平台10个，新增校外科技投入1．92亿元，依托政校企合作平台建成的两个教育部工程中心顺利通过教育部组织的验收。
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