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长期以来，南京大学经济学系在著名经济学家洪银兴教授、刘志彪教授等前任系主任的带领下，一直注重经济学本科教育，不断探索人才培养的创新模式，取得了显著成效。自2007年4月以来，在现任系主任安同良、葛扬等教授的继承与发展下，针对近年来国内大学经济学教育重西方经济学轻政治经济学、重工具传授轻综合能力培养、重“精英”式人才培养轻“应用”型人才培养、重经济学知识传授轻相关学科知识传授、重研究生教学轻本科生教学等现象，努力探索经济学人才培养的新模式，初步形成了以“四个集成”为主要内容的“经济学人才培养集成创新模式”。 2007年，经济学系获得教育部“优秀教学团队”、“特色专业建设点”，2008年获得教育部“人才培养模式创新实验区”。
第一，指导思想集成。强调在马克思主义经济学为本位的基础上，集成西方经济学的合理内核与方法。一方面，不断深化马克思主义经济学的本位与指导地位：主要体现在对马克思主义经济理论的发展研究上，如加强马克思资本论与中国发展实践的研究，增加具有留学欧美、日本学术背景的对马克思主义素有研究的师资；《〈资本论〉导读》、《经济思想史》等作为重点建设的核心课程群。另一方面，西方经济学作为当代成熟市场经济运行发展的理论总结和提炼，比较偏重于对经济现象的表层描述和分析，我们在坚持马克思主义经济学指导地位的基础上，充分借鉴、扬弃与学习西方经济学，努力进行两种理论的集成。
第二，课程集成。课程集成主要是通过模块组成实现的:（1）经济学基础理论模块(资本论、政治经济学、经济思想史、宏观经济学、微观经济学、国际经济学等)；（2）经济学基础技能模块（数理经济学、计量经济学、博弈论、信息经济学、实验经济学、多元统计分析等)；（3）经济学专业理论模块(产业经济学、制度经济学研究、公共经济学、金融学、国际贸易学、区域经济学等)；（4）研究性课程及创新技能训练模块(现代经济学前沿、文献选读seminar、课程论文、调研、经济学实践前沿、学位论文等)。
积极倡导以一流的科研促进一流的教学，教师科研水平的提升不仅拓宽了教学视野，而且深化了教学内容，带来了教学质量的提高。经济学系13名教授全部给本科学生开设专业核心课，其中包括2位长江计划特聘教授、2位国家级教学名师、3位教育部新世纪优秀人才。在课程教学上，对于青年教师，充分发挥他们具有现代经济学专业分析能力和外语能力的优势，鼓励他们开设理论前沿课。而对于有一定难度又相对成熟的课程，比如政治经济学（社会主义部分）课程，组成以名教授为主的教授团队来进行授课。在高水平教师带领下，学生学会了对处在转型期的中国经济问题的分析，努力把握社会主义市场经济国家经济发展的基本规律。
第三，学科集成。目前已在经济学与管理学两大一级学科之间进行了有效集成，也正在努力加强与数学、法学、社会学、计算机等学科的集成，特别是在经济学人才培养上正在开设数学系的3门课，加强经济学本科阶段分析工具的掌握和分析能力的训练。
学科集成的关键是建设跨学科交叉的创新团队。经济学人才培养集成创新模式尝试组织跨院系、跨专业的柔性科学研究的创新团队。创新根据现代经济学研究领域或研究方向进行组织，鼓励经济学与不同学科之间的交叉，制定创新团队的管理办法，把对创新团队的管理纳入日常的科研管理中。在具体做法上，我们安排相关学科的教师在经济学系开设学术讲座，鼓励本系学生选修其他院系的相关课程，也鼓励去外国大学进行交流的学生跨学科选修课程。
第四，模式集成。我们通过广泛了解不同国家、不同学校的经济学人才培养模式，根据自己的实际情况，博采众长，优势集成，探求南京大学独具特色的经济学人才培养集成创新模式。以A（学术）、B（就业）双轨制为导向，实现培养模式的根本转轨：对A轨学生增设数学系的3门课：实分析、泛函、随机过程等，加强现代经济学分析工具的掌握，如数理经济学、实验经济学、计量经济学、博弈论等，强化其科研创新能力；对B轨学生，以社会实践、《经济学实践前沿讲座》拓展其实践视角。
通过核心课程建设、实践前沿课程开设、导师制的实行、学士工作站的建立，以及设立本科生科研项目招标制度、举办“斯密论坛”、创办《南大经济评论》刊物等多种途径，着力培养本科生科研能力和实际工作能力，努力打造对学生进行“集成培养”的优良环境。
通过“经济学人才培养集成创新模式”的探索，培养了一大批勤奋进取、学风朴实、基础扎实、科研能力强、综合素质优良的既具有经济学家思维的理论人才，同时又善于经济建设的高层次应用人才。
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