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1、科技成果喜传捷报。在2009年度科技奖励中，获得国家自然科学二等奖1项，国家技术发明二等奖1项，国家科技进步二等奖1项；获得教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖8项（全国高校名列第一），二等奖5项；江苏省科技进步奖一等奖1项，二等奖2项。
2、国家目标导向的重大科研项目取得了新的突破。获得5个国家973计划（含重大科学研究计划）首席科学家项目，这是我校自国家973计划（含重大科学研究计划）实施以来所获得首席科学家最多的一年。参与了多个国家重大科学专项。主持国家自然科学基金重大项目1项。
3、科研经费稳步增长。2009年度科研经费达到5.54亿元。
4、科技队伍人才济济。获得3项国家杰出青年科学基金资助项目。国家自然科学基金批准立项235项，获批经费1.12亿元。教育部新世纪优秀人才支持计划项目16项（理工科）。教育部创新团队1项。
5、专利战略成绩显著。2009年度我校共申请发明专利394件，授权发明专利209件。专利实施许可32项，合同总额1637万元。获2009年度第四届中国发明协会发明创业奖1项，第十八届全国专利博览会金奖1项。
6、SCI论文质量不断提高。据中国科学技术信息研究所公布的SCI论文统计结果，2008年度我校被SCI收录文献1571篇，其中影响因子大于3.0的536篇，论文质量进一步提高。
7、重点实验室建设工作成绩优异。现代配位化学国家重点实验室与生命分析化学教育部重点实验室参加国家重点实验评估成绩名列前茅。近代声学、海岸与海岛开发和中尺度灾害性天气等三个教育部重点实验室在教育部组织的评估中均被评良好。现代天文与天体物理和模式动物与疾病研究二个教育部重点实验室通过验收，正式进入开放运行阶段。
8、国防科研结硕果。国庆60周年大阅兵多件尖端装备使用的某特种材料主要由我校研制。2009年我校两项国防科研基础建设项目进入实施阶段，标志着南京大学成为该领域重要研发基地。
9、科技成果转化持续发展。新建政产学研合作平台4个，新增校外科技投入1.11亿元。在建12个政产学研合作平台不断拓展。
10、服务国家地方经济社会发展取得新进展。“国家有机毒物污染控制与资源化工程技术研究中心”获批建设，实现我校国家级工程技术研究中心零的突破；“南京大学宜兴环保研发中心”获批科技部“国家中小环保企业科技服务示范平台”。
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