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社会科学是研究人类社会现象及其规律的科学。当今，社会系统所表现出的越来越强烈的复杂性特征，正不断向社会科学研究方法论提出新的挑战。
从科学哲学意义上讲，历史上自然科学、社会科学若干学科曾经从哲学中分离出来又被不断分化，而现在又出现了学科间界限不断被打破、边界不断被重新划分的学科交叉与融合的大趋势。在一定意义上，这是当代“大科学”时代的一个基本特点。这一趋势的出现，需要社会科学进行更多研究，更积极地移植和借用其他学科的研究方法与工具，并且通过跨学科合作的路径提高社会科学研究能力，这既反映了当代社会科学研究发展的大趋势，也反映了社会科学与人类整个科学文明一起“与时俱进”的大趋势，是一件值得重视的大事。当今国内外社会科学研究的许多成功案例告诉我们，“在学科交叉与融合的边缘发现科学问题，在学科交叉与融合的过程中解决科学问题”已成普遍规律。
从2001年起，我们开始运用跨学科的计算实验方法开展对复杂社会系统宏微观层次之间相互作用以及系统整体状态演化规律的研究，研究领域涉及经济系统演化、公共管理、环境治理、重大工程管理等，取得了一定的成功。2007年，在社科处的领导下，我校正式成立了“南京大学社会科学计算实验中心”，中心先后主持承担了国家自然科学基金重大项目、重点项目、国家社科基金重大招标项目、国家科技支撑计划项目等，在上海三联书店出版社、科学出版社出版了一批学术著作，在国际学术刊物上发表了一批学术论文，获得教育部科技进步一等奖、省哲学社会科学一等奖等，培养的博士生获得2013年全国优博提名。这些较好研究成果的取得，其重要原因就在于在研究中坚持了学科交叉与融合的方法。
回顾十多年跨学科研究的探索，我们有以下初步的体会：
一、运用学科交叉与融合方法研究社会科学问题是当代社会科学研究的大趋势，需要在宏观上有推动这一大趋势的科学研究战略思考与制度安排，并逐步形成促进、鼓励学科交叉与融合的体制。
二、社会科学跨学科合作研究，除要对社会系统与社会科学方法论有新的科学认知外，更需要进行体制的顶层设计，如建立有利于不同学院、学科跨学科合作研究的动力学机制等。
三、运用多学科交叉与融合的方法开展社会科学研究，关键是人才。这样的人才除了要有大科学学术理念外，还要有较广阔的知识面并掌握跨学科研究的手段与技术。当前，人文社科青年骨干教师在学科交叉问题上普遍存在“先天不足”与“乏力”状况，应引起高度重视，可以在优秀的年轻学术骨干中开展跨学科知识更新与系统综合能力提高等工作。
四、在高水平大学内，有选择和有重点地建立以学科交叉为主要特色的社会科学研究基地是完全必要的。这些基地既是大学跨学科合作开展社会科学研究的创新基地，又能够起到重要的推广和示范作用。
五、大力营造有利于跨学科研究的学术文化氛围。跨学科研究是一项创新性极强的工作，需要大力营造有利于跨学科研究的学术文化氛围，对研究人员的业绩考核、对研究成果的认定以及对探索中可能有的失败都要有更加辩证、宽容的态度。
六、加强相应的国际合作与交流。应该通过多种途径加强这方面的国际合作与交流，在合作与交流中提高自己、增长才干，形成自己的学术品牌。
学科交叉与融合当头，创新就在其中了。在当前我校开展的进一步深化科研体制改革的工作中，我们应该认真总结、反思和探索社会科学研究方法论的创新路径，努力开创繁荣和发展我校社会科学研究的新局面。
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