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首先，进一步统一思想，增强对科技工作的认识。一是要强调科技工作的重要性，人才培养是学校的根本，科学研究是学校的生命线。评价研究型大学的办学水平、竞争力和国内外地位，主要是看科研水平。南京大学之所以能在上世纪八九十年代异军突起，正是因为抓好了科研，抓好了SCI。近几年来，我校的国家级科技奖励、重大人才计划以及高水平科技论文数量都有所下降，因此全校上下都要有忧患意识，真正把科技工作作为全校的核心工作来抓。二是要准确定位基础研究和应用研究的关系，目前我校的基础研究优势有所减弱，应用研究的劣势尚未有明显改观，发表论文的数量和质量在C9高校中并不靠前。不进则退，慢进也是退，既要扬长又要补短，在国家强调创新驱动发展战略的背景下，我校要全力以赴，积极争取和参与国家重大科技创新项目，加强应用研究。
其次，坚持“心中有理想，体制内运行”，制定并实施有效的科技工作战略。科学研究既要将高远的目标作为心中的理想，沉心钻研，不受干扰，同时也要适应体制内的运行规则，重视国家的各项评价指标，特别是重大科研项目、国家级奖励、重要论文、重要专利成果等方面的指标。为巩固并提升在国内外的地位，我校将继续实施“金牌战略”和“登峰战略”，重视对重要奖项奖源的培育，重视高水平论文的发表，鼓励长江学者、国家杰出青年基金获得者冲击各类国家级奖项，学校的经费支持及资源分配将会继续向符合“金牌战略”、“登峰战略”的项目和团队倾斜。此外，针对各个学科、各个院系的科研成果分布不平衡状况，需要尽快找出短板，制定针对性举措，迎头赶上。
再次，改革科技工作体制机制，调动科学研究的精气神。既要有压力，也要有动力。一是要重激励，明确重点，重拾上世纪八九十年代卧薪尝胆抓SCI的精神，激励在高等级杂志发表高水平论文者，激励国家重要奖励获得者，激励科研高峰的执着攀登者。二是要严考核，针对学校77%的长江学者、国家杰出青年基金获得者未获得过国家奖（前三名），未有一人当选院士的现状，学校将在继续大力支持的前提下提出更为明确的目标，确保优秀领军人才不辜负国家和学校的期望。三是要聚贤才，坚持人才强校战略，引进高水平科技人才，做出高水平科研工作。四是抓应用，依托已经建立的20多个平台为地方服务，参与到国家的创新驱动战略的实施中。
最后，加强组织和管理，提升成效，规避风险。重要奖励、重大项目的申报都需要良好组织引导基础，科研管理部门要有小孩吃糖的精神，嘴里含一个，手里抓一个，眼里看一个，创造一种好的组织模式，不断培育出优质奖源和项目团队。由我校领衔的南海研究协同创新中心以优秀成绩通过考察的过程中，各个部门通力协作，严密、高效的组织工作发挥了关键的作用，说明加强组织和协同就能出生产力。对于科研经费，则应该加强管理，科研经费是财政性资金，是纳税人的钱，不能随便使用。教育部发文要对科研经费使用进行检查，全校教师在科研经费使用中都要时刻警醒，不能存有侥幸心理，要严肃对待学校正在开展的科研经费自查自纠活动，防患于未然。
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