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暑假期间教育部召开了一系列会议，刘延东副总理在教育部直属高校工作咨询会上指出，当前高校改革的重点是深化人才培养体制改革、深化人事管理制度改革、深化科研管理体制改革和深化院系管理体制改革。开学前学校召开了党政联席会，学习了教育部的文件精神，讨论了我校目前面临的形势和任务，形成了本学期行政工作的九大任务：
一、启动新一轮学科建设
深入分析教育部公布的第三轮学科评估结果，我校仍存在着许多不足：一些传统优势学科竞争力有所减退；文科和工科排位前三名的较少，没有一个金牌学科；具体到指标体系中，许多学科输在一些重要指标上，比如高水平科研成果、顶级期刊论文、人才培养、国际交流的指标等。本学期我们要在深入分析一级学科评估结果的基础上，结合学科发展前沿和国家重大需求，下大力气启动新一轮学科建设，调整学科布局，优化学科结构，集中各方力量，发展优势学科。
要加强优势学科建设。今年我校又有社会科学和计算机学科进入ESI前1%，总数已达13个，这说明我校优势学科实力进一步增强，越来越多的学科在国际上崭露头角。本学期，学校将在物理学院、化学化工学院和文学院等院系进一步深入推进优势学科引领发展计划，优化国际评估程序，制定国际评估办法，推进优势学科在国内占据主导地位，早日达到世界一流水平。
要加强现代工科建设。最近几年，学校工程学科发展迅速，但由于工程学科在队伍考核、人才培养、科学研究等方面尚未建立自己的完整体系，对发展产生了一些影响和制约。本学期学校将进一步推进工程学科评估体系建设。
要调整弱势学科，大力发展有潜力的新兴学科和新的学科方向。根据教育部文件，我校的一级学科博士点将固定在40个，以后下一个才能上一个。学校将制定规则对各个学科进行评估，对一些确实没有发展前景和潜力的弱势学科进行调整和淘汰。各个院系要高度重视，对各个学科深入分析并制定好发展规划。
要优化学科布局。我校目前学科之间发展不平衡，例如在2012年国家基金委面上项目申请中，我校获得基金委项目最多的是地学，超过1/4，实际上地学部在基金委的总占比不足10%，而在支持力度相对较高的信息、生物医学科学部我们却比较弱。这说明在整个自然科学领域我们的布局还不够合理，不足以支撑南大一流大学建设。每一个学科都要认真分析学科发展现状，瞄准学科前沿，根据学科发展趋势在某些方面提前布局，强化特色和优势，加大人才引进力度，保持学科活力和竞争力。
今年是“985工程”三期第一阶段和“江苏高校优势学科建设工程”建设的最后一年，全校必须全力以赴做好检查验收准备。
二、大力推进人事管理制度改革
一是进一步推进用人制度的改革。要在全校教师选聘实行专职科研队伍制度的基础上，吸收Tenure-track制度的优点，丰富完善其建设内涵，确保师资选拔能行得通、选得准、留得优。要对教师以外的其他专业技术队伍和行政管理队伍的用人制度进行改革，所有人员都要经过不进编阶段的使用选拔，达到一定水准再实行进编管理。要以确保人才培养的中心地位、促进优势学科良性发展、优化师资队伍结构、控制用人规模为导向，完成新一轮的编制核算工作。
二是探索高层次人才考核评价体系。要根据“三高一严”的要求切实做好我校高层次人才队伍的评价考核，本学期实施 中期评估。通过科学的评估和后续服务，充分调动和激发高层次人才的积极性和创造力，促使他们产出高质量的科研成果。同时要着手并做好专职科研队伍聘期考核。
三是继续做好青年教师的流转工作。各院系、各单位要形成共识，稳妥推进。任讲师满6年、年龄40岁以上的教师要进入流转程序，其中任讲师满8年者必须完成流转。在大外部、体育部等公共教学部门研究设立专任教员岗位，保证公共教学队伍稳定。达不到专任教员任职要求的需进行流转。
四是加强博士后招收和培养工作。统筹专职科研和博士后两支队伍建设，改变目前博士后薪酬学校出大头的现状，充分调动院系和合作导师在博士后培养中的积极性和责任感。参照专职科研制度改革博士后薪酬方案，减少在职博士后的比例，改善博士后招收结构，真正做到博士后招收用得上，干得好。
三、实施第二阶段 “三三制”教学改革
在充分总结第一个周期经验和专家意见的基础上，学校确定从今年9月1号开始，进入“三三制”本科教学改革的第二阶段。这个阶段改革的核心内容是提高课堂教学质量，尤其要提升课程研究、讲授、评价、管理的水平和质量，把“三三制”改革的重心从宏观转向微观、从培养体系改革转向课堂质量提升。重点要在加强课程信息化建设和提高教学教师队伍的水平上下功夫。
去年以来在高等教育界出现的一个大事件是由世界名牌大学联合主导和推动的大规模开放网络课程的兴起，这股潮流正快速影响到全世界，国内一流大学围绕开放网络课程展开的激烈竞争序幕已经拉开。我们应该积极稳妥地迎接和参与这场革命，寻找南大课程信息化途径，具体抓三个层次：
第一个层次：所有课程公开化、规范化。要求全校各院系将所有开设的课程都在教务处的课程与教学网站上发布，包括主讲教师及教学团队简介、每门课程的教学大纲和详细教学计划、阅读参考资料和课程资源尤其是同类课程的网站资源、课程考核评价模式、选课人数等。
第二个层次：强化课外指导，深化师生互动。完善网络互动交流平台、并与教务系统信息共享与对接；选拔教学理念先进、网络使用水平较高的部分教师利用该平台，开展资源共享、作业提交、课后问题讨论等活动。
第三个层次：实施网络精品课程示范工程。精心选拔并下大力气打造南大优质精品网络课程，参与国内外大规模网络课程的竞争。这是教学与科研结合的一个新战场，是科研、教学和高层次人才培养一体化建设的一个新舞台。
提高课程质量的关键是提升教学教师队伍的水平。本学期学校将通过多种措施着力优化与“三三制”教改相匹配的高水平本科教学师资队伍建设：建立新进教师岗前教学专题培训制度，促进教师教学培训的制度化、专业化；通过名师工作坊等形式开展针对性教学咨询服务，推动教学方法改革；设立南京大学青年教师教学成果奖，激励广大青年教师投身教学、研究教学；选择部分院系试点“课程责任教授”制度，负责课程设计和讲授，承担教学团队建设和课程助教培训等。
四、启动博士生培养机制改革
改革方案将以全面提高博士生培养质量为核心，以面向研究生全过程的质量管理为主线，在研究生培养的预锁定阶段、硕士生阶段、博士生阶段、弹性延长阶段把好入口优化关、过程控制关、弹性出口关，同时实施分阶段、分类型、分层次的激励机制，建设具有南京大学特色的“四三三”研究生培养新体系。主要改革措施有以下四个方面：
一是改革招生选拔方式，建立博士研究生招生计划分配新机制。博士生招生要以质量为导向建立招生计划动态调节机制，实现博士生培养的入口优化。今后各院系博士生招生计划由基准计划额度和动态计划额度两部分组成，其中动态计划额度由招生基准规模数的百分之十、每年教育部下达招生计划增量以及教育部目前试行的弹性招生计划数三部分构成，将基于各院系博士生培养全过程质量、培养条件质量和培养模式改革质量等指标体系的建设与实施效果，实行动态调节。
二是建立择优分流机制，构建博士生培养新模式。要强化过程管理和特色培养，严格资格考核，有效实现分类培养、分层激励、择优分流。各院系要以博士学位基本要求和培养目标为依据，制定切实可行的培养方案，严格实行博士生资格考试，明确每次考试优秀率和暂缓通过率，建立切实可行的通过机制。
三是构建激励导向的弹性学制，积极探索拔尖人才培养新途径。改革方案对博士生学习年限实行弹性学制，适当放宽对博士生学习年限的限制，实施南京大学优秀博士研究生创新能力提升计划，其中A计划奖励金额为每年8万元，B计划奖励金额为每年4.2万元，以鼓励在读期间已取得优秀成果的博士生延长学习期限（1-2年），继续深入开展科学研究，充分完成具有挑战性或者更好的学术成果。
四是建立健全博士生奖助体系，进一步突出激励功能。从本学期起，学校将全面提高博士生待遇水平，全日制博士研究生普通奖学金从每月1000元增加到1200元，以保证博士生专注于科研和学习。改革方案将通过建立分阶段、分类型、分层次的激励机制和多元化博士生资助体系，吸引优秀生源，鼓励竞争，奖励优秀，充分发挥对不同阶段、不同类型、不同层次博士生的激励作用，激发博士生的学习主动性和创新积极性。加大对基础学科、国家急需学科博士生的资助力度，完善研究生国家助学贷款政策，提高助学贷款额度，扩大助学贷款覆盖面。
五、大力加强科技管理体制改革
下半年要再接再厉完成全年的科研指标。要加强“2011计划”协同创新中心建设，学校将研究制定《南京大学“2011计划”协同创新管理办法》及相关配套支持政策，建立对各类协同创新中心的支持机制和考核评估体系，积极推进协同创新中心的实质性运行。
要重视高水平科研成果的培育。上半年全校已经发表SCI一区论文65篇和学科群顶级期刊论文21篇，分别相当于去年全年的73%和100%，NPI指数排名已经上升到全国第6位，我们仍需继续努力。另外我们在组织明年的国家奖、优秀创新团队和国家杰青申报方面要提前准备。
要改革科技评价体系。目前我校科技评价体系存在的主要问题是：重个人轻团队，对合作科研中团队成员的贡献缺乏合理评估；重眼前轻长远，缺乏对科研过程的评估。学校将尽快研究制定《南京大学关于推进科技评价改革的指导意见》，大力倡导潜心研究、追求科学本质的学术氛围，加强对重点实验室、创新群体等科研机构的整体考核，突出围绕重大需求催生重大成果产出导向、服务经济社会加快创新驱动发展导向，构建以创新质量和实际贡献为核心的评价指标体系和开放科学的评价方法。
要加强文科新型智库建设。建设中国特色的新型智库，是深化教育领域综合改革、实现高等教育内涵发展的迫切需求。中国南海研究协同创新中心，正是定位于打造南海问题的高端智库而首批入选国家“2011计划”。在保持基础研究优势的同时，我校各级文科基地建设，要本着“国家急需、世界一流、制度先进、贡献重大”的原则，按照问题导向，整合协同校内外力量，打破封闭、低效、重复等壁垒，积极培育组建各类新型智库，积极申报教育部新一轮的人文社科重点研究基地和文科“2011计划”。
六、大力提升国际化办学水平
近年来我校本科生出境交流率已持续保持在30%以上，但海外交流生和留学生的增长速度不如人意，这一弱点已经在这次学科评估中显现出来。本学期要确定2-4个院系试办国际专业，集中开设国际化课程群，供国际学生和本校学生修读。
推进文科科研国际化是一项十分紧迫的任务。在高校文科国际排名方面，我校文科面临很大压力。与兄弟院校相比，我校SSCI和A&HCI发文量有较大差距，鼓励文科教师在SSCI和A&HCI杂志上发文，是本学期的重要任务。
提高文科科研国际化的一个重要途径是我们的文科教师要积极走出去与境外机构、智库合作，积极学习境外智库建设经验，借鉴国外社会科学研究的方法，直面和解决经济社会发展的理论和现实问题。
文科科研的国际化，还要坚持以我为主和中国特色、中国立场。学校已启动两岸四地合作计划，将我校创制的中文人文社会科学引文索引（CSSCI）办成国际学界认可的基础评价数据库。本学期，国家汉办支持的由我校牵头的“孔子新汉学丛书”工作要积极推进，《南京大屠杀全史》等一批文科标志性成果的外译推介工作要稳步进行。整合汇聚国际关系研究的力量，提升我校国际关系问题的话语权，也是本学期要加紧进行的工作。
七、大力加强节约化校园建设
一是切实执行学校关于公用房分配与有偿使用的相关规定。在大多数院系的积极支持下，学校的公用房改革政策已取得良好的实施效果，加强了公用房的科学合理配置，提高了公用房的使用效率。对于个别至今不予配合的院系，本学期要采取针对性措施予以解决。
二是加快房地产信息系统建设。在目前已完成的公用房管理模块的基础上，本学期要完成住房补贴信息管理模块、周转房管理模块、维修信息管理模块的开发工作，争取早日全面上线运行。
三是逐步推进我校公费医疗体制改革。在充分开展教职工参保调研工作的基础上为我校教职工参保做好准备。
四是加强绿色校园建设。积极通过加大宣传教育、推广节能产品应用、建设能源监管监控系统等措施做好鼓楼、仙林校区的节粮节水节电工作，实现“十二五”节能减排水电资源人均下降20%的管理目标。
八、深化财务管理体制改革
本学期要进一步完善科研经费学校、院系、项目（课题）三级管理体系，成立“科研经费管理服务中心”，构建符合科研工作规律的项目经费管理体制，强化立项、预算和经费使用全过程监管，切实保证科研经费使用的安全高效。要进一步加强“三公”经费和会议经费管理，根据中央八项规定和教育部实施办法，修订《南京大学会议经费管理办法》，实行综合费用和项目预算控制，严格控制一般性办公经费支出，严格控制和规范各类出访出国活动。
九、加强反腐倡廉工作
本学期，教育部将对我校进行科研经费管理专项检查。学校在继续开展科研经费自查自纠工作同时，要以落实审计整改要求为抓手，严格按照有关文件要求，修订完善我校财务管理、科研经费管理方面的规章制度，加强对科技合同的审核把关，完善经费报销制度，积极开展重点领域的教育和监督工作，做好有关违规问题的处理，增强全校教职员工的法制意识和工作规范，有效提升科研经费使用效益，促进我校科研事业健康发展。
改革是当前高等教育的共同主题。袁贵仁部长在今年的全国教育工作会议上指出，改革是教育发展的强大动力，并表示今后几年教育部的“一号文件”都将是推进教育改革的文件。面对这样的改革形势，我们一定要抓住机遇、迎难而上，以坚强的决心和勇气全面深化改革，攻坚克难迎来学校事业跨越发展的新高峰。
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