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一流学科是一流大学的重要标志。这些年来，我校一直高度重视学科建设工作，围绕创建“世界一流大学”的战略目标，坚持以学科建设为龙头、机制创新为动力，贯彻落实“突出重点，注重效益，创新机制，激发活力”的建设思想，通过整合学科资源，优化布局结构，创新机制体制，着力提升内涵，学科建设取得长足进展，学科内涵显著提升，为我校创建世界一流大学奠定了坚实基础。
一、在继续保持文理基础学科优势与特色的基础上，紧密围绕国家战略性需求和国际学术发展趋势，积极探索学科结构从文理型向文理工医多学科协调发展转变，初步形成了文、理、工、医协调发展的学科体系。
一直以来，学校一直积极探索学科发展规律，完善学科布局，优化学科结构，突破文理型综合性大学模式，不断推进优势文理科向现代应高工学科的延伸机制，社会科学、工程科学得到快速发展，并成为我校高水平学科创新体系的重要组成部分。依托优势理科，通过理工融合的方式，组建了电子科学与工程学院、现代工程和应用科学学院、大气科学学院、地球科学与工程学院、建筑与城市规划学院、天文与空间科学学院等多个应高工类学院；实施医学院振兴行动计划，建设转化医学中心等平台，完善医学学科的组织体系，力争在基础医学和临床医学两方面形成优势和特色；推进传统人文学科向现代社会科学学科的拓展，新组建了文学院、政府管理学院、社会学院等多个文科学院。在2011年年底的国家一级学科博士点授予权的评审中，我校共获得40个一级学科博士授权点，其中人文学科（包括哲学、文学、历史学、艺术学门类）8个，社会科学（包括经济学、法学、管理学门类）10个，理科（理学门类）10个，工科（共学门类）9个，医科（医学门类）3个，文理工医多学科协调发展的格局已经初步形成，显著提高了我校学科体系的适应性与发展活力。
二、在“211工程”、“985工程”、“江苏高校优势学科建设工程”的强力支持下，充分激发学校、院系、学科、部处和教师队伍的活力，加强各职能部处的联动、协调、合作，学科内涵明显提升。
随着“211工程”、“985工程”的深入推进和“江苏高校优势学科建设工程”的全面启动，我校基础学科优势进一步凸显，一批哲学社会科学学科得到加强，交叉学科、新兴学科和应高工学科取得新突破，大部分学科在国内名列前茅并形成重要影响力。在未与其他高校合并的情况下，在2007年国家重点学科评审中，二级重点学科总数从28个增加到37个，获得了8个一级国家重点学科，是全国高校唯一一个6个基础理科学科全部获得一级重点学科的学校；在2009年教育部公布的《学科评估高校排名结果》中，我校参评的23个学科中，17个学科获得前五名，其中物理学、天文学、大气科学等3个学科位居全国第1，12个参评的人文社会学科中9个学科位居前五，继续保持了在国内高校的前列位置；根据ESI的统计数据，我校进入ESI排名前1％的学科从2008年的7个已经增加到现在的11个，而且各学科的排位也得到大幅提升，其中化学学科发表论文总数和被引总次数在全球科研机构中的排名分别为15名和41名。
三、打破学科壁垒，创新学科组织模式，统筹资源配置，促进学科动态调整，积极探索建立分类别、多层次的学科发展模式与评价机制，加大学科国际化力度，增强学科发展活力。
根据学科自身特征与发展阶段，我校积极探索以优势文理科为主的引领式发展、以工科与社会科学为主的支撑式发展以及以医科为主的扶持式发展模式，既充分调动各类教学和科研人员的积极性，发挥学校优势学科的特色，又力争做到在各学科间既有重点又协调发展，根据学科的实际情况，给予相应的经费支持和政策支持；探讨不同学科的管理办法和评价指标体系，尝试建立分类别、多层次的学科发展模式与评价机制，形成有利于不同学科协调共生、支撑发展的生态环境和建设模式，目前正在积极制订工科评价机制，在物理学、化学、中国语言文学等学科推进国际化评价机制；打破院系与学科壁垒，以重大科学问题和国家重大需求为导向组织重大项目，形成一批具有高度灵活性和适应性的交叉学科平台与研究基地，推进学科组织模式创新和新兴交叉学科的成长，我校在近几年相继成立了气候与全球变化研究院、能源科学研究院、水科学研究院、中华文化研究院等交叉研究院，以促进多学科的深度交融与合作。目前，我校在物质科学、地球与环境科学、信息科学、生命科学与医学、中华传统文化研究等领域已初步形成了一批具有创新活力的交叉学科方向。
在党的“十八大”即将召开之际，我校学校建设将继续创新机制，提升内涵，强化特色，进一步推进形成文理工医多学科合理布局，主干学科、支撑学科、新兴交叉学科结构优化的高水平学科体系，探索一条中国特色、世界水平的一流大学建设之路，加快推进南京大学创建世界一流大学的进程。
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