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1999年底，西安交通大学出台了一系列旨在鼓励博士生标新立异，发挥主动性和创造性的新措施，立刻引起教育界尤其是高校的强烈反响。2000年初，西安交通大学组织了全校博士生创新教育大讨论。讨论之后，全校上下达成共识，尤其是得到了诸多老专家学者的首肯，最后，研究生院将提高博士生创新能力的措施归为八项予以推出：
措施一 弹性学制 弹性学制为3～6年。此项措施为博士生创新提供了时间保证。3～6年的弹性学制符合教育规律，学制太长虽有利于提高培养质量，但人才成长周期长不利于发挥人才资源，也过多的消耗教育资源；学制短则不可能培养出高质量的博士。同时，弹性学制也符合科学研究规律，有利于鼓励博士生创造型地从事科学研究工作和承担风险选题，向科学前沿冲击。
措施二 完全学分制 实行完全学分制，在教师资源有限和课程设置有限的条件下，允许博士生根据自己的知识结构与科研工作的需要，在全校当年博士、硕士课程目录上选修课程，这样可以更充分地利用学校的整体办学资源。
措施三 讲座与学术研讨制 此项措施为博士生创新提供了广阔的思维空间。以讲座、学术研讨班等形式进行课程教学，加强了博士生与任课教师和导师之间，博士生之间的学术交流。博士生不仅有针对性地选听学术讲座，也需要紧跟学术前沿准备自己的学术讲座。
措施四 转换导师制 此项措施为博士生创新提供了自主选题的保证。在过去的长时间里，博士生教育一直沿用导师指导制，由导师制定博士生的研究方向，研究课题，甚至论文题目，这就制约了博士生个性的发展和创新能力的发挥，而转换导师制规定，博士生因研究方向或研究课题的变化或者与导师的研究方向不符时，允许博士生转换导师，打破了过去博士生“一师定终生”“从一而终”的培养模式。此举要求导师转变观念，解放思想，注重博士生的个性发展，注重引导他们的科研兴趣，鼓励和支持博士生进行创新性成果和风险性的学位论文选题，利于形成更加开放的学术环境。
措施五 风险选题制 此项措施为博士生创新原则上提供了申请学位的保证，为其创新风险解除了后顾之忧。风险选题制就是鼓励博士生在未知的领域里进行探索，成功了就能够取得大创新、大成果，当然失败的可能性也很大。科学研究也允许失败。对于未达到预期目标的风险选题，博士论文应重点阐述研究过程，论证失败原因和其研究过程获得的阶段成果或其他研究成果，以及进一步研究的方向和方法，这对科学研究也有很大的参考价值，使后来者少走弯路，这在一定意义也是研究成果，也能反映一个博士生独立从事科研工作的能力与水平，因而允许其申请学位。这项提高博士生创新能力的举措，本身也是一个巨大的创新。
措施六 博士学位论文基金和拔尖人才基金制 设立博士学位论文基金是支持博士生提出自己的创新性学术思想，鼓励具有前沿性、开拓性和风险性的博士学位论文选题，对其进行资金支持。设立拔尖人才基金，是为拔尖人才提供更好的成长环境，有利于培养真正站在世界科学前沿的学术带头人和尖子人才。
措施七 博士创造性成果评价制 此项措施为博士生创新提供了良好学风保证。博士生创造性成果是博士学位论文水平的标志，是衡量是否授予申请者博士学位的尺度，应以科学、求实的态度评价它。博士生申请博士论文答辩应高度概括自己的创造性成果，认真填写《博士学位论文创造性成果评价表》，提交评审专家匿名评审。实行该项制度有利于博士生端正学术作风，实事求是地总结自己的科研成果，杜绝不劳而获、剽窃他人成果，有效遏止剪刀加糨糊出’成果”的现象，使真正的创新成果脱颖而出。
措施八 奖励优秀制 为鼓励优秀论文不断上水平，学校设立优秀博士论文奖。经严格评选获得学校和国家优秀博士论文者可授予优秀博士论文单项奖，发给奖励证书和奖金。
西安交通大学为提高博士生创新能力不仅体现在诸多措施实施等大的方面，也从点滴小事上下工夫，切实体现“以提高博士生创新能力为本”，比如说，举办模拟国际会议
因为诸多条件限制，许多博士生在校期间没有参加国际学术会议进行学术交流的机会，因而他们对如何参加学术会议，如何投稿以及如何用英文宣讲论文，如何用英文讨论等知之甚少。1997年12月，西安交通大学举办了第一届模拟国际学术会议。这次会议的筹备组织工作全部由博士生协会承担，会议的所有过程都尽可能按照国际学术会议的惯例来展开，可以说有过之而无不及，一般的国际学术会议不可能人人演讲，而模拟国际学术会议则为每一位参加者提供了宣读论文的机会。无论是组织者还是参加者都得到了极大的锻炼和提高。
(《光明日报》2001.11.1)
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